inquirybg

Себаткило, Аваш, Эфиопиядағы Anopheles масаларының геномдық популяциялық генетикасы және инсектицидтерге төзімділігінің молекулалық мониторингі

2012 жылы Джибутиде табылғалы бері Азиялық Anopheles stephensi масасы бүкіл Африка мүйізіне тарады. Бұл инвазивті вектор бүкіл континентке таралуды жалғастыруда, бұл безгекке қарсы күрес бағдарламаларына үлкен қауіп төндіреді. Векторлық бақылау әдістері, соның ішінде инсектицидтермен өңделген төсек торлары және үй ішіндегі қалдық бүрку безгек ауруын айтарлықтай азайтты. Дегенмен, инсектицидтерге төзімді масалардың, соның ішінде Anopheles stephensi популяциясының көбеюі безгекті жою бойынша жүргізіліп жатқан жұмыстарға кедергі келтіруде. Популяция құрылымын, популяциялар арасындағы гендер ағынын және инсектицидтерге төзімді мутациялардың таралуын түсіну безгекке қарсы тиімді стратегияларды басқару үшін маңызды.
Ан. Стефенсидің HOA-да орныққаны сонша, оның жаңа аймақтарға таралуын болжау үшін өте маңызды. Популяциялық генетика популяция құрылымын, ағымдағы таңдауды және гендер ағынын түсіну үшін вектор түрлерін зерттеу үшін кеңінен қолданылды18,19. Ан үшін. Stephensi, популяция құрылымын және геном құрылымын зерттеу оның инвазия жолын және пайда болғаннан бері болуы мүмкін кез келген бейімделу эволюциясын анықтауға көмектеседі. Ген ағынынан басқа, іріктеу өте маңызды, өйткені ол инсектицидтерге төзімділікпен байланысты аллельдерді анықтай алады және осы аллельдердің популяция арқылы қалай таралатынын түсіндіре алады20.
Бүгінгі таңда Anopheles stephensi инвазиялық түрлерінде инсектицидтерге төзімділік маркерлері мен популяциялық генетиканы сынау бірнеше кандидат гендермен шектелді. Түрдің Африкада пайда болуы толық түсінілмеген, бірақ бір гипотеза оны адамдар немесе малдар енгізген. Басқа теорияларға жел арқылы ұзақ қашықтыққа көшу жатады. Бұл зерттеуде пайдаланылған эфиопиялық изоляттар Аддис-Абебадан шығысқа қарай 200 км жерде және Аддис-Абебадан Джибутиге дейінгі негізгі көлік дәлізінде орналасқан Аваш Себат Кило қаласында жиналды. Awash Sebat Kilo - безгектің жоғары таралу аймағы және Anopheles stephensi популяциясы көп, бұл инсектицидтерге төзімді деп хабарланады, бұл оны Anopheles stephensi8 популяциясының генетикасын зерттеу үшін маңызды орынға айналдырады.
Инсектицидке төзімділік kdr L1014F мутациясы Эфиопия популяциясында төмен жиілікте анықталды және үнді далалық үлгілерінде анықталмады. Бұл kdr мутация пиретроидтерге және ДДТ-ға төзімділік береді және бұрын Анда анықталған. stephensi популяциясы 2016 жылы Үндістанда және 2018 жылы Ауғанстанда жиналған.31,32 Екі қалада да кең таралған пиретроидты төзімділіктің дәлелдеріне қарамастан, мұнда талданған Мангалор және Бангалор популяцияларында kdr L1014F мутациясы анықталмады. Гетерозиготалы болған осы SNP алып жүретін эфиопиялық изоляттардың төмен үлесі мутацияның осы популяцияда жақында пайда болғанын көрсетеді. Мұны Awash қаласындағы алдыңғы зерттеу осында талданғандардан бір жыл бұрын жиналған үлгілерде kdr мутациясының ешқандай дәлелін таппағанымен расталады.18 Біз осы kdr L1014F мутациясын ампликонды анықтау тәсілін пайдаланып, сол аймақтан/жылдағы үлгілер жинағында төмен жиілікте анықтадық.28 Осы сынама алу учаскелерінің барлық төмен жиілігіндегі кедергілік тетіктердегі фенотиптік қарсылықты ескере отырып, осы сынамаларды алудың барлық басқа тетіктерінен гөрі кедергісі белгіленетінін көрсетеді. модификация осы байқалатын фенотипке жауапты.
Бұл зерттеудің шектеуі инсектицидтерге реакция туралы фенотиптік деректердің болмауы болып табылады. Бұл мутациялардың инсектицидтік реакцияға әсерін зерттеу үшін геномды тұтас секвенирлеуді (WGS) немесе мақсатты ампликон секвенциясын сезімталдықтың биоанализімен біріктіретін қосымша зерттеулер қажет. Қарсылықпен байланысты болуы мүмкін бұл жаңа қателік SNPs мониторингті қолдау және қарсылық фенотиптерімен байланысты әлеуетті механизмдерді түсіну және тексеру үшін функционалдық жұмысты жеңілдету үшін жоғары өнімді молекулалық талдауларға бағытталған болуы керек.
Қорытындылай келе, бұл зерттеу континенттердегі Anopheles масаларының популяциясының генетикасын тереңірек түсінуге мүмкіндік береді. Әртүрлі географиялық аймақтардағы үлгілердің үлкен топтарына тұтас геномдық реттілік (WGS) талдауын қолдану гендер ағынын түсіну және инсектицидтерге төзімділік маркерлерін анықтау үшін кілт болады. Бұл білім денсаулық сақтау органдарына векторларды бақылау мен инсектицидтерді қолдануда саналы таңдау жасауға мүмкіндік береді.
Біз осы деректер жинағындағы көшірме санының өзгеруін анықтау үшін екі әдісті қолдандық. Біріншіден, біз геномдағы анықталған CYP генінің кластерлеріне бағытталған қамтуға негізделген тәсілді қолдандық (қосымша кесте S5). Үлгіні қамту көлемі жинау орындары бойынша орташа алынған және төрт топқа бөлінді: Эфиопия, Үнді далалары, Үнді отарлары және Пәкістан колониялары. Әрбір топ үшін қамту ядроны тегістеу арқылы қалыпқа келтірілді, содан кейін осы топ үшін орташа геномды қамту тереңдігіне сәйкес сызылған.


Жіберу уақыты: 23 маусым-2025 ж